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Target has curated data in GtoImmuPdb
Target id: 606
Nomenclature: Pregnane X receptor
Systematic Nomenclature: NR1I2
Gene and Protein Information | |||||
Species | AA | Chromosomal Location | Gene Symbol | Gene Name | Reference |
Human | 434 | 3q13.33 | NR1I2 | nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 | 2,4,18 |
Mouse | 431 | 16 B3 | Nr1i2 | nuclear receptor subfamily 1, group I, member 2 | 18 |
Rat | 431 | 11q21 | Nr1i2 | nuclear receptor subfamily 1, group I, member 2 | 39 |
Database Links | |
Alphafold | O75469 (Hs), O54915 (Mm), Q9R1A7 (Rn) |
CATH/Gene3D | 3.30.50.10 |
ChEMBL Target | CHEMBL3401 (Hs), CHEMBL1743244 (Mm), CHEMBL2146315 (Rn) |
DrugBank Target | O75469 (Hs) |
Ensembl Gene | ENSG00000144852 (Hs), ENSMUSG00000022809 (Mm), ENSRNOG00000002906 (Rn) |
Entrez Gene | 8856 (Hs), 18171 (Mm), 84385 (Rn) |
Human Protein Atlas | ENSG00000144852 (Hs) |
KEGG Gene | hsa:8856 (Hs), mmu:18171 (Mm), rno:84385 (Rn) |
OMIM | 603065 (Hs) |
Pharos | O75469 (Hs) |
RefSeq Nucleotide | NM_003889 (Hs), NM_022002 (Hs), NM_033013 (Hs), NM_010936 (Mm), NM_001098404 (Mm), NM_052980 (Rn) |
RefSeq Protein | NP_148934 (Hs), NP_003880 (Hs), NP_071285 (Hs), NP_001091874 (Mm), NP_035066 (Mm), NP_443212 (Rn) |
SynPHARM |
6467 (in complex with hyperforin) 6465 (in complex with SR12813) |
UniProtKB | O75469 (Hs), O54915 (Mm), Q9R1A7 (Rn) |
Wikipedia | NR1I2 (Hs) |
Selected 3D Structures | |||||||||||||
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Natural/Endogenous Ligands |
17β-estradiol |
3-keto-lithocholic acid |
lithocholic acid |
Comments: Xenobiotics, steroids and benzoates have been proposed as the natural ligands |
Download all structure-activity data for this target as a CSV file
Agonists | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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View species-specific agonist tables | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Agonist Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Some environmental xenobiotics (e.g. polychlorinated biphenyls or PCBs, 1,1-dichloro-2,2-bis (p-chlorophenyl)ethylene)) [26,35], and pesticides (e.g. transnonachlor and chlordane) [26] have also been shown to activate PXR. |
Antagonists | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Antagonist Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The notion that Ecteinascidin 743 (ET-743) as a PXR antagonist is controversial. It was thought the inhibitory effect may result from the cytotoxicity of this potent antineoplastic agent. |
Immunopharmacology Comments |
PXR is validated target for immune and inflammatory diseases. Antibacterial-independent PXR-mediated efficacy of rifaximin in the treament of irritable bowel syndrome (IBS; FDA approved in 2015), has confirmed PXR as an IBS molecular target. Selective PXR ligands are being actively pursued, as tools to fully investigate the therapeutic relevance of the receptor. |
Co-binding Partners | |||
Name | Interaction | Effect | Reference |
PIT1 | Physical | Cellular localization | 12 |
Main Co-regulators | ||||||
Name | Activity | Specific | Ligand dependent | AF-2 dependent | Comments | References |
NCOA1 | Co-activator | No | No | No | 18 | |
NRIP1 | Co-activator | No | No | No | 5 | |
PPARGC1A | Co-activator | No | No | No | 3 | |
FOXO1 | Co-activator | No | No | No | 19 | |
NR0B2 | Co-repressor | No | No | No | 25 | |
GRIP1 | Co-activator | No | No | No | 29 | |
NCOR2 | Co-repressor | No | No | No | 30,32 |
Main Target Genes | |||||
Name | Species | Effect | Technique | Comments | References |
cytochrome P450 | Human | Activated | Transient transfection, EMSA, Other | mCYP3A11, rCYP3A23, hCYP3A4, hCYP2C8, hCYP2C9, mCYP2B10, hCYP2B6 (h-human,m-mouse,r-rat) | 2,4,6,9,14,18,30,36 |
Slco1a4 | Mouse | Activated | Transient transfection, EMSA, Other | Oatp2, Slc21a5 | 15 |
Abcc2 | Mouse | Activated | Transient transfection, EMSA | 17 | |
Ugt1a1 | Mouse | Activated | Transient transfection, EMSA | 38 | |
Sult2a1 | Mouse | Activated | Transient transfection, EMSA | 27 | |
Abcb1b | Mouse | Activated | Transient transfection, EMSA | 11 | |
Alas1 | Mouse | Activated | Transient transfection, EMSA | 10 |
Tissue Distribution | ||||||||||
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Tissue Distribution Comments | ||||||||||
Low levels in kidney and lungs. A similar pattern is seen in mice. |
Physiological Consequences of Altering Gene Expression | ||||||||||
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Phenotypes, Alleles and Disease Models | Mouse data from MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Clinically-Relevant Mutations and Pathophysiology | ||||||||||||||||
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Biologically Significant Variants | ||||||||||||||
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